Muzeul a fost înființat în 1930 pe baza unor colecții anterioare și a colecției alcătuite de Societatea Muzeistică din Miercurea Ciuc. A fost instituționalizat în 1949. În 1970 s-a mutat în cetatea Mikó, monument istoric. Cuprinde piese de istorie; arheologie: tezaurul dacic de argint descoperit la Sâncrăieni-Ciuc; etnografie: port, țesături, cusături, ceramică; artă: sculpturi și picturi medievale, desene și acuarele ale pictorului Márton Ferenc; colecția de carte veche (biblioteca franciscană de la Șumuleu-Ciuc). În 1972 s-a aprobat înființarea unei secții în aer liber, pe terenul din spatele cetății Mikó. În prezent, secția în aer liber este alcătuită din șase case țărănești (din Ciucsângiorgiu, Cozmeni, Plăieșii de Sus, Joseni, Sânsimion și Corund), o fântână, un grânar, 16 porți secuiești și un fragment de poartă.
Sediul muzeului este în proces de restaurare și prezintă expoziții pe anumite aripi, pentru a permite măcar parțial accesul vizitatorilor la colecțiile muzeului. Modul de prezentare este modern și atractiv folosind mijloace video și audio.De asemenea, muzeul are o bogată agendă de expoziții temporare.